[1] Altschul, S. F.; Gish, W.; Miller, W.; Myers, E. W.; Lipman, D. J. Basic local alignment search tool, Journal of Molecular Biology, Volume 215 (1990) no. 3, pp. 403-410
|
Article
[2] Andersson, R.; Gebhard, C.; Miguel-Escalada, I.; Hoof, I.; Bornholdt, J.; Boyd, M.; Chen, Y.; Zhao, X.; Schmidl, C.; Suzuki, T.; Ntini, E.; Arner, E.; Valen, E.; Li, K.; Schwarzfischer, L.; Glatz, D.; Raithel, J.; Lilje, B.; Rapin, N.; Bagger, F. O.; Jørgensen, M.; Andersen, P. R.; Bertin, N.; Rackham, O.; Burroughs, A. M.; Baillie, J. K.; Ishizu, Y.; Shimizu, Y.; Furuhata, E.; Maeda, S.; Negishi, Y.; Mungall, C. J.; Meehan, T. F.; Lassmann, T.; Itoh, M.; Kawaji, H.; Kondo, N.; Kawai, J.; Lennartsson, A.; Daub, C. O.; Heutink, P.; Hume, D. A.; Jensen, T. H.; Suzuki, H.; Hayashizaki, Y.; Müller, F.; Forrest, A. R. R.; Carninci, P.; Rehli, M.; Sandelin, A. An atlas of active enhancers across human cell types and tissues, Nature, Volume 507 (2014) no. 7493, pp. 455-461
|
Article
[3] Bae, B.-I.; Jayaraman, D.; Walsh, C. A. Genetic Changes Shaping the Human Brain, Developmental Cell, Volume 32 (2015) no. 4, pp. 423-434
|
Article
[4] Bakken, T. E.; Miller, J. A.; Ding, S.-L.; Sunkin, S. M.; Smith, K. A.; Ng, L.; Szafer, A.; Dalley, R. A.; Royall, J. J.; Lemon, T.; Shapouri, S.; Aiona, K.; Arnold, J.; Bennett, J. L.; Bertagnolli, D.; Bickley, K.; Boe, A.; Brouner, K.; Butler, S.; Byrnes, E.; Caldejon, S.; Carey, A.; Cate, S.; Chapin, M.; Chen, J.; Dee, N.; Desta, T.; Dolbeare, T. A.; Dotson, N.; Ebbert, A.; Fulfs, E.; Gee, G.; Gilbert, T. L.; Goldy, J.; Gourley, L.; Gregor, B.; Gu, G.; Hall, J.; Haradon, Z.; Haynor, D. R.; Hejazinia, N.; Hoerder-Suabedissen, A.; Howard, R.; Jochim, J.; Kinnunen, M.; Kriedberg, A.; Kuan, C. L.; Lau, C.; Lee, C.-K.; Lee, F.; Luong, L.; Mastan, N.; May, R.; Melchor, J.; Mosqueda, N.; Mott, E.; Ngo, K.; Nyhus, J.; Oldre, A.; Olson, E.; Parente, J.; Parker, P. D.; Parry, S.; Pendergraft, J.; Potekhina, L.; Reding, M.; Riley, Z. L.; Roberts, T.; Rogers, B.; Roll, K.; Rosen, D.; Sandman, D.; Sarreal, M.; Shapovalova, N.; Shi, S.; Sjoquist, N.; Sodt, A. J.; Townsend, R.; Velasquez, L.; Wagley, U.; Wakeman, W. B.; White, C.; Bennett, C.; Wu, J.; Young, R.; Youngstrom, B. L.; Wohnoutka, P.; Gibbs, R. A.; Rogers, J.; Hohmann, J. G.; Hawrylycz, M. J.; Hevner, R. F.; Molnár, Z.; Phillips, J. W.; Dang, C.; Jones, A. R.; Amaral, D. G.; Bernard, A.; Lein, E. S. A comprehensive transcriptional map of primate brain development, Nature, Volume 535 (2016) no. 7612, pp. 367-375
|
Article
[5] Bejerano, G.; Pheasant, M.; Makunin, I.; Stephen, S.; Kent, W. J.; Mattick, J. S.; Haussler, D. Ultraconserved Elements in the Human Genome, Science, Volume 304 (2004) no. 5675, pp. 1321-1325
|
Article
[6] Bernstein, B. E.; Birney, E.; Dunham, I.; Green, E. D.; Gunter, C.; Snyder, M. An integrated encyclopedia of DNA elements in the human genome, Nature, Volume 489 (2012) no. 7414, pp. 57-74
|
Article
[7] Boyd, J. L.; Skove, S. L.; Rouanet, J. P.; Pilaz, L.-J.; Bepler, T.; Gordân, R.; Wray, G. A.; Silver, D. L. Human-Chimpanzee Differences in a FZD8 Enhancer Alter Cell-Cycle Dynamics in the Developing Neocortex, Current Biology, Volume 25 (2015) no. 6, pp. 772-779
|
Article
[8] Brudno, M.; Malde, S.; Poliakov, A.; Do, C. B.; Couronne, O.; Dubchak, I.; Batzoglou, S. Glocal alignment: finding rearrangements during alignment, Bioinformatics, Volume 19 (2003) no. Suppl 1
|
Article
[9] Bulchand, S.; Subramanian, L.; Tole, S. Dynamic spatiotemporal expression of LIM genes and cofactors in the embryonic and postnatal cerebral cortex, Developmental Dynamics, Volume 226 (2003) no. 3, pp. 460-469
|
Article
[10] Carroll, S. B. Evolution at Two Levels: On Genes and Form, PLoS Biology, Volume 3 (2005) no. 7
|
Article
[11] Cecchi, C.; Mallamaci, A.; Boncinelli, E. Otx and Emx homeobox genes in brain development, Int J Dev Biol, Volume 44 (2000)
|
Article
[12] Dekker, J.; Mirny, L. The 3D Genome as Moderator of Chromosomal Communication, Cell, Volume 164 (2016) no. 6, pp. 1110-1121
|
Article
[13] Dixon, J. R.; Gorkin, D. U.; Ren, B. Chromatin Domains: The Unit of Chromosome Organization, Molecular Cell, Volume 62 (2016) no. 5, pp. 668-680
|
Article
[14] Ernst, J.; Kellis, M. ChromHMM: automating chromatin-state discovery and characterization, Nature Methods, Volume 9 (2012) no. 3, pp. 215-216
|
Article
[15] Erwin, D. H.; Davidson, E. H. The evolution of hierarchical gene regulatory networks, Nature Reviews Genetics, Volume 10 (2009) no. 2, pp. 141-148
|
Article
[16] Fulco, C. P.; Munschauer, M.; Anyoha, R.; Munson, G.; Grossman, S. R.; Perez, E. M.; Kane, M.; Cleary, B.; Lander, E. S.; Engreitz, J. M. Systematic mapping of functional enhancer–promoter connections with CRISPR interference, Science, Volume 354 (2016) no. 6313, pp. 769-773
|
Article
[17] Gerstein, M. B.; Kundaje, A.; Hariharan, M.; Landt, S. G.; Yan, K.-K.; Cheng, C.; Mu, X. J.; Khurana, E.; Rozowsky, J.; Alexander, R.; Min, R.; Alves, P.; Abyzov, A.; Addleman, N.; Bhardwaj, N.; Boyle, A. P.; Cayting, P.; Charos, A.; Chen, D. Z.; Cheng, Y.; Clarke, D.; Eastman, C.; Euskirchen, G.; Frietze, S.; Fu, Y.; Gertz, J.; Grubert, F.; Harmanci, A.; Jain, P.; Kasowski, M.; Lacroute, P.; Leng, J.; Lian, J.; Monahan, H.; O’Geen, H.; Ouyang, Z.; Partridge, E. C.; Patacsil, D.; Pauli, F.; Raha, D.; Ramirez, L.; Reddy, T. E.; Reed, B.; Shi, M.; Slifer, T.; Wang, J.; Wu, L.; Yang, X.; Yip, K. Y.; Zilberman-Schapira, G.; Batzoglou, S.; Sidow, A.; Farnham, P. J.; Myers, R. M.; Weissman, S. M.; Snyder, M. Architecture of the human regulatory network derived from ENCODE data, Nature, Volume 489 (2012) no. 7414, pp. 91-100
|
Article
[18] He, Z.; Han, D.; Efimova, O.; Guijarro, P.; Yu, Q.; Oleksiak, A.; Jiang, S.; Anokhin, K.; Velichkovsky, B.; Grünewald, S.; Khaitovich, P. Comprehensive transcriptome analysis of neocortical layers in humans, chimpanzees and macaques, Nature Neuroscience, Volume 20 (2017) no. 6, pp. 886-895
|
Article
[19] Hermanson, O.; Sugihara, T. M.; Andersen, B. Expression of LMO-4 in the central nervous system of the embryonic and adult mouse, . Cell Mol Biol, Volume 45 (1999)
[20] Inoue, J.; Sato, Y.; Sinclair, R.; Tsukamoto, K.; Nishida, M. Rapid genome reshaping by multiple-gene loss after whole-genome duplication in teleost fish suggested by mathematical modeling, Proceedings of the National Academy of Sciences, Volume 112 (2015) no. 48, pp. 14918-14923
|
Article
[21] Kundaje, A.; Meuleman, W.; Ernst, J.; Bilenky, M.; Yen, A.; Heravi-Moussavi, A.; Kheradpour, P.; Zhang, Z.; Wang, J.; Ziller, M. J.; Amin, V.; Whitaker, J. W.; Schultz, M. D.; Ward, L. D.; Sarkar, A.; Quon, G.; Sandstrom, R. S.; Eaton, M. L.; Wu, Y.-C.; Pfenning, A. R.; Wang, X.; Claussnitzer, M.; Liu, Y.; Coarfa, C.; Harris, R. A.; Shoresh, N.; Epstein, C. B.; Gjoneska, E.; Leung, D.; Xie, W.; Hawkins, R. D.; Lister, R.; Hong, C.; Gascard, P.; Mungall, A. J.; Moore, R.; Chuah, E.; Tam, A.; Canfield, T. K.; Hansen, R. S.; Kaul, R.; Sabo, P. J.; Bansal, M. S.; Carles, A.; Dixon, J. R.; Farh, K.-H.; Feizi, S.; Karlic, R.; Kim, A.-R.; Kulkarni, A.; Li, D.; Lowdon, R.; Elliott, G.; Mercer, T. R.; Neph, S. J.; Onuchic, V.; Polak, P.; Rajagopal, N.; Ray, P.; Sallari, R. C.; Siebenthall, K. T.; Sinnott-Armstrong, N. A.; Stevens, M.; Thurman, R. E.; Wu, J.; Zhang, B.; Zhou, X.; Beaudet, A. E.; Boyer, L. A.; De Jager, P. L.; Farnham, P. J.; Fisher, S. J.; Haussler, D.; Jones, S. J. M.; Li, W.; Marra, M. A.; McManus, M. T.; Sunyaev, S.; Thomson, J. A.; Tlsty, T. D.; Tsai, L.-H.; Wang, W.; Waterland, R. A.; Zhang, M. Q.; Chadwick, L. H.; Bernstein, B. E.; Costello, J. F.; Ecker, J. R.; Hirst, M.; Meissner, A.; Milosavljevic, A.; Ren, B.; Stamatoyannopoulos, J. A.; Wang, T.; Kellis, M. Integrative analysis of 111 reference human epigenomes, Nature, Volume 518 (2015) no. 7539, pp. 317-330
|
Article
[22] Lane, M. E.; Runko, A. P.; Roy, N. M.; Sagerström, C. G. RETRACTED: Dynamic expression and regulation by Fgf8 and Pou2 of the zebrafish LIM-only gene, lmo4, Gene Expression Patterns, Volume 2 (2002) no. 3-4, pp. 207-211
|
Article
[23] Lowe, C. B.; Kellis, M.; Siepel, A.; Raney, B. J.; Clamp, M.; Salama, S. R.; Kingsley, D. M.; Lindblad-Toh, K.; Haussler, D. Three Periods of Regulatory Innovation During Vertebrate Evolution, Science, Volume 333 (2011) no. 6045, pp. 1019-1024
|
Article
[24] Lyons, E.; Freeling, M. How to usefully compare homologous plant genes and chromosomes as DNA sequences, The Plant Journal, Volume 53 (2008) no. 4, pp. 661-673
|
Article
[25] Mariani, J.; Favaro, R.; Lancini, C.; Vaccari, G.; Ferri, A. L.; Bertolini, J.; Tonoli, D.; Latorre, E.; Caccia, R.; Ronchi, A.; Ottolenghi, S.; Miyagi, S.; Okuda, A.; Zappavigna, V.; Nicolis, S. K. Emx2 is a dose-dependent negative regulator of Sox2 telencephalic enhancers, Nucleic Acids Research, Volume 40 (2012) no. 14, pp. 6461-6476
|
Article
[26] McCollum, C. W.; Amin, S. R.; Pauerstein, P.; Lane, M. E. A zebrafish LMO4 ortholog limits the size of the forebrain and eyes through negative regulation of six3b and rx3, Developmental Biology, Volume 309 (2007) no. 2, pp. 373-385
|
Article
[27] McEwen, G. K.; Goode, D. K.; Parker, H. J.; Woolfe, A.; Callaway, H.; Elgar, G. Early Evolution of Conserved Regulatory Sequences Associated with Development in Vertebrates, PLoS Genetics, Volume 5 (2009) no. 12
|
Article
[28] McLean, C. Y.; Bristor, D.; Hiller, M.; Clarke, S. L.; Schaar, B. T.; Lowe, C. B.; Wenger, A. M.; Bejerano, G. GREAT improves functional interpretation of cis-regulatory regions, Nature Biotechnology, Volume 28 (2010) no. 5, pp. 495-501
|
Article
[29] Melé, M.; Ferreira, P. G.; Reverter, F.; DeLuca, D. S.; Monlong, J.; Sammeth, M.; Young, T. R.; Goldmann, J. M.; Pervouchine, D. D.; Sullivan, T. J.; Johnson, R.; Segrè, A. V.; Djebali, S.; Niarchou, A.; Consortium, T. G.; Wright, F. A.; Lappalainen, T.; Calvo, M.; Getz, G.; Dermitzakis, E. T.; Ardlie, K. G.; Guigó, R. The human transcriptome across tissues and individuals, Science, Volume 348 (2015) no. 6235, pp. 660-665
|
Article
[30] Miller, J. A.; Ding, S.-L.; Sunkin, S. M.; Smith, K. A.; Ng, L.; Szafer, A.; Ebbert, A.; Riley, Z. L.; Royall, J. J.; Aiona, K.; Arnold, J. M.; Bennet, C.; Bertagnolli, D.; Brouner, K.; Butler, S.; Caldejon, S.; Carey, A.; Cuhaciyan, C.; Dalley, R. A.; Dee, N.; Dolbeare, T. A.; Facer, B. A. C.; Feng, D.; Fliss, T. P.; Gee, G.; Goldy, J.; Gourley, L.; Gregor, B. W.; Gu, G.; Howard, R. E.; Jochim, J. M.; Kuan, C. L.; Lau, C.; Lee, C.-K.; Lee, F.; Lemon, T. A.; Lesnar, P.; McMurray, B.; Mastan, N.; Mosqueda, N.; Naluai-Cecchini, T.; Ngo, N.-K.; Nyhus, J.; Oldre, A.; Olson, E.; Parente, J.; Parker, P. D.; Parry, S. E.; Stevens, A.; Pletikos, M.; Reding, M.; Roll, K.; Sandman, D.; Sarreal, M.; Shapouri, S.; Shapovalova, N. V.; Shen, E. H.; Sjoquist, N.; Slaughterbeck, C. R.; Smith, M.; Sodt, A. J.; Williams, D.; Zöllei, L.; Fischl, B.; Gerstein, M. B.; Geschwind, D. H.; Glass, I. A.; Hawrylycz, M. J.; Hevner, R. F.; Huang, H.; Jones, A. R.; Knowles, J. A.; Levitt, P.; Phillips, J. W.; Šestan, N.; Wohnoutka, P.; Dang, C.; Bernard, A.; Hohmann, J. G.; Lein, E. S. Transcriptional landscape of the prenatal human brain, Nature, Volume 508 (2014) no. 7495, pp. 199-206
|
Article
[31] Notwell, J. H.; Chung, T.; Heavner, W.; Bejerano, G. A family of transposable elements co-opted into developmental enhancers in the mouse neocortex, Nature Communications, Volume 6 (2015) no. 1
|
Article
[32] Ocaña, F. M.; Suryanarayana, S. M.; Saitoh, K.; Kardamakis, A. A.; Capantini, L.; Robertson, B.; Grillner, S. The Lamprey Pallium Provides a Blueprint of the Mammalian Motor Projections from Cortex, Current Biology, Volume 25 (2015) no. 4, pp. 413-423
|
Article
[33] Okbay, A.; Beauchamp, J. P.; Fontana, M. A.; Lee, J. J.; Pers, T. H.; Rietveld, C. A.; Turley, P.; Chen, G.-B.; Emilsson, V.; Meddens, S. F. W.; Oskarsson, S.; Pickrell, J. K.; Thom, K.; Timshel, P.; de Vlaming, R.; Abdellaoui, A.; Ahluwalia, T. S.; Bacelis, J.; Baumbach, C.; Bjornsdottir, G.; Brandsma, J. H.; Pina Concas, M.; Derringer, J.; Furlotte, N. A.; Galesloot, T. E.; Girotto, G.; Gupta, R.; Hall, L. M.; Harris, S. E.; Hofer, E.; Horikoshi, M.; Huffman, J. E.; Kaasik, K.; Kalafati, I. P.; Karlsson, R.; Kong, A.; Lahti, J.; Lee, S. J. v. d.; deLeeuw, C.; Lind, P. A.; Lindgren, K.-O.; Liu, T.; Mangino, M.; Marten, J.; Mihailov, E.; Miller, M. B.; van der Most, P. J.; Oldmeadow, C.; Payton, A.; Pervjakova, N.; Peyrot, W. J.; Qian, Y.; Raitakari, O.; Rueedi, R.; Salvi, E.; Schmidt, B.; Schraut, K. E.; Shi, J.; Smith, A. V.; Poot, R. A.; St Pourcain, B.; Teumer, A.; Thorleifsson, G.; Verweij, N.; Vuckovic, D.; Wellmann, J.; Westra, H.-J.; Yang, J.; Zhao, W.; Zhu, Z.; Alizadeh, B. Z.; Amin, N.; Bakshi, A.; Baumeister, S. E.; Biino, G.; Bønnelykke, K.; Boyle, P. A.; Campbell, H.; Cappuccio, F. P.; Davies, G.; De Neve, J.-E.; Deloukas, P.; Demuth, I.; Ding, J.; Eibich, P.; Eisele, L.; Eklund, N.; Evans, D. M.; Faul, J. D.; Feitosa, M. F.; Forstner, A. J.; Gandin, I.; Gunnarsson, B.; Halldórsson, B. V.; Harris, T. B.; Heath, A. C.; Hocking, L. J.; Holliday, E. G.; Homuth, G.; Horan, M. A.; Hottenga, J.-J.; de Jager, P. L.; Joshi, P. K.; Jugessur, A.; Kaakinen, M. A.; Kähönen, M.; Kanoni, S.; Keltigangas-Järvinen, L.; Kiemeney, L. A. L. M.; Kolcic, I.; Koskinen, S.; Kraja, A. T.; Kroh, M.; Kutalik, Z.; Latvala, A.; Launer, L. J.; Lebreton, M. P.; Levinson, D. F.; Lichtenstein, P.; Lichtner, P.; Liewald, D. C. M.; Cohort Study, L.; Loukola, A.; Madden, P. A.; Mägi, R.; Mäki-Opas, T.; Marioni, R. E.; Marques-Vidal, P.; Meddens, G. A.; McMahon, G.; Meisinger, C.; Meitinger, T.; Milaneschi, Y.; Milani, L.; Montgomery, G. W.; Myhre, R.; Nelson, C. P.; Nyholt, D. R.; Ollier, W. E. R.; Palotie, A.; Paternoster, L.; Pedersen, N. L.; Petrovic, K. E.; Porteous, D. J.; Räikkönen, K.; Ring, S. M.; Robino, A.; Rostapshova, O.; Rudan, I.; Rustichini, A.; Salomaa, V.; Sanders, A. R.; Sarin, A.-P.; Schmidt, H.; Scott, R. J.; Smith, B. H.; Smith, J. A.; Staessen, J. A.; Steinhagen-Thiessen, E.; Strauch, K.; Terracciano, A.; Tobin, M. D.; Ulivi, S.; Vaccargiu, S.; Quaye, L.; van Rooij, F. J. A.; Venturini, C.; Vinkhuyzen, A. A. E.; Völker, U.; Völzke, H.; Vonk, J. M.; Vozzi, D.; Waage, J.; Ware, E. B.; Willemsen, G.; Attia, J. R.; Bennett, D. A.; Berger, K.; Bertram, L.; Bisgaard, H.; Boomsma, D. I.; Borecki, I. B.; Bültmann, U.; Chabris, C. F.; Cucca, F.; Cusi, D.; Deary, I. J.; Dedoussis, G. V.; van Duijn, C. M.; Eriksson, J. G.; Franke, B.; Franke, L.; Gasparini, P.; Gejman, P. V.; Gieger, C.; Grabe, H.-J.; Gratten, J.; Groenen, P. J. F.; Gudnason, V.; van der Harst, P.; Hayward, C.; Hinds, D. A.; Hoffmann, W.; Hyppönen, E.; Iacono, W. G.; Jacobsson, B.; Järvelin, M.-R.; Jöckel, K.-H.; Kaprio, J.; Kardia, S. L. R.; Lehtimäki, T.; Lehrer, S. F.; Magnusson, P. K. E.; Martin, N. G.; McGue, M.; Metspalu, A.; Pendleton, N.; Penninx, B. W. J. H.; Perola, M.; Pirastu, N.; Pirastu, M.; Polasek, O.; Posthuma, D.; Power, C.; Province, M. A.; Samani, N. J.; Schlessinger, D.; Schmidt, R.; Sørensen, T. I. A.; Spector, T. D.; Stefansson, K.; Thorsteinsdottir, U.; Thurik, A. R.; Timpson, N. J.; Tiemeier, H.; Tung, J. Y.; Uitterlinden, A. G.; Vitart, V.; Vollenweider, P.; Weir, D. R.; Wilson, J. F.; Wright, A. F.; Conley, D. C.; Krueger, R. F.; Davey Smith, G.; Hofman, A.; Laibson, D. I.; Medland, S. E.; Meyer, M. N.; Yang, J.; Johannesson, M.; Visscher, P. M.; Esko, T.; Koellinger, P. D.; Cesarini, D.; Benjamin, D. J. Genome-wide association study identifies 74 loci associated with educational attainment, Nature, Volume 533 (2016) no. 7604, pp. 539-542
|
Article
[34] Pauls, S.; Goode, D. K.; Petrone, L.; Oliveri, P.; Elgar, G. Evolution of lineage-specific functions in ancient
cis
-regulatory modules, Open Biology, Volume 5 (2015) no. 11
|
Article
[35] Pennacchio, L. A.; Ahituv, N.; Moses, A. M.; Prabhakar, S.; Nobrega, M. A.; Shoukry, M.; Minovitsky, S.; Dubchak, I.; Holt, A.; Lewis, K. D.; Plajzer-Frick, I.; Akiyama, J.; De Val, S.; Afzal, V.; Black, B. L.; Couronne, O.; Eisen, M. B.; Visel, A.; Rubin, E. M. In vivo enhancer analysis of human conserved non-coding sequences, Nature, Volume 444 (2006) no. 7118, pp. 499-502
|
Article
[36] Rakic, P. Evolution of the neocortex: a perspective from developmental biology, Nature Reviews Neuroscience, Volume 10 (2009) no. 10, pp. 724-735
|
Article
[37] Reilly, S. K.; Yin, J.; Ayoub, A. E.; Emera, D.; Leng, J.; Cotney, J.; Sarro, R.; Rakic, P.; Noonan, J. P. Evolutionary changes in promoter and enhancer activity during human corticogenesis, Science, Volume 347 (2015) no. 6226, pp. 1155-1159
|
Article
[38] Shlyueva, D.; Stampfel, G.; Stark, A. Transcriptional enhancers: from properties to genome-wide predictions, Nature Reviews Genetics, Volume 15 (2014) no. 4, pp. 272-286
|
Article
[39] Smemo, S.; Tena, J. J.; Kim, K.-H.; Gamazon, E. R.; Sakabe, N. J.; Gómez-Marín, C.; Aneas, I.; Credidio, F. L.; Sobreira, D. R.; Wasserman, N. F.; Lee, J. H.; Puviindran, V.; Tam, D.; Shen, M.; Son, J. E.; Vakili, N. A.; Sung, H.-K.; Naranjo, S.; Acemel, R. D.; Manzanares, M.; Nagy, A.; Cox, N. J.; Hui, C.-C.; Gomez-Skarmeta, J. L.; Nóbrega, M. A. Obesity-associated variants within FTO form long-range functional connections with IRX3, Nature, Volume 507 (2014) no. 7492, pp. 371-375
|
Article
[40] Vavouri, T.; Lehner, B. Conserved noncoding elements and the evolution of animal body plans, BioEssays, Volume 31 (2009) no. 7, pp. 727-735
|
Article
[41] Wang, J.; Zhuang, J.; Iyer, S.; Lin, X.; Whitfield, T. W.; Greven, M. C.; Pierce, B. G.; Dong, X.; Kundaje, A.; Cheng, Y.; Rando, O. J.; Birney, E.; Myers, R. M.; Noble, W. S.; Snyder, M.; Weng, Z. Sequence features and chromatin structure around the genomic regions bound by 119 human transcription factors, Genome Research, Volume 22 (2012) no. 9, pp. 1798-1812
|
Article
[42] Wang, Y.; Song, F.; Zhang, B.; Zhang, L.; Xu, J.; Kuang, D.; Li, D.; Choudhary, M. N. K.; Li, Y.; Hu, M.; Hardison, R.; Wang, T.; Yue, F. The 3D Genome Browser: a web-based browser for visualizing 3D genome organization and long-range chromatin interactions, Genome Biology, Volume 19 (2018) no. 1
|
Article
[43] Wenger, A. M.; Clarke, S. L.; Notwell, J. H.; Chung, T.; Tuteja, G.; Guturu, H.; Schaar, B. T.; Bejerano, G. The Enhancer Landscape during Early Neocortical Development Reveals Patterns of Dense Regulation and Co-option, PLoS Genetics, Volume 9 (2013) no. 8
|
Article
[44] Won, H.; de la Torre-Ubieta, L.; Stein, J. L.; Parikshak, N. N.; Huang, J.; Opland, C. K.; Gandal, M. J.; Sutton, G. J.; Hormozdiari, F.; Lu, D.; Lee, C.; Eskin, E.; Voineagu, I.; Ernst, J.; Geschwind, D. H. Chromosome conformation elucidates regulatory relationships in developing human brain, Nature, Volume 538 (2016) no. 7626, pp. 523-527
|
Article